Las canciones de la store son compatibles con cualquier versión del Rock Band.
A mi personalmente me gusta más el rock band por cómo presenta las notas en los mástiles y por poder poner efectos de sonido a la guitarra.
El G.H. tiene un editor de canciones que puede estar muy bien. A parte de eso no sé si hay alguna diferencia relevante entre ambos.
En cuanto a instrumentos, la batería del G.H. es mejor y la guitarra dl RB es mejor que la del G.H.
Si tienes dudas, lo mejor es alquilarte ambos y probar o si tienes amigos que tengan los juegos, probarlos y ver por ti mismo.
Saludos!!