El sobrenombre de Volgin está sacado de un personaje real, Georgi Valentínovich Plejánov, uno de los líderes del comunismo ruso. Se apodó “Volgin” refiriéndose al río ruso Volga, al contrario que su opositor político dentro del movimiento, Lennin que se refería al río Lena.
El año en el que empieza la Misión Virtuosa es el primer aniversario de Hideo Kojima. El creador iba a usar su fecha de nacimiento, 24 de Agosto de 1963 porque quería que el asesinato de Kennedy fuera un factor clave en la historia, pero decidió posponerla un año más tarde.
En ruso, "Shagohod" significa "bípedo".
Tselinoyarsk es un nombre de ficción para una localización de ficción. Curiosamente, está compuesta por varias palabras rusas: Tselina (Tierra virgen), Yar (Montaña) y Sk (Fin del Mundo).
El nombre de Raidenovich viene de una palabra japonesa, que pronunciada es algo así como "Raiden no bitch" ("Raiden no zorra") y que se traduce literalmente como "Thunderbolt´s Bitch" (La Zorra de Thunderbolt).
En Metal Gear 2, Big Boss fue modelado tras Sean Connery. Éste fue uno de los factores que llevaron a Kojima a idear un estilo de las películas de 007 en Metal Gear Solid 3. Ya que si el viejo Big Boss es el viejo Sean Connery, entonces el joven Big Boss sería el joven Sean Connery. Y éste es James Bond. En definitiva: Naked Snake es James Bond.
En la pantalla del Game Over, la referencia "Time Paradox" es un homenaje a la trilogía de Regreso al Futuro, donde Doc Emmett Brown usa constantemente la frase "Paradoja Temporal". Curiosamente, el doblador japonés de Doc es Takeshi Aono, la voz de Roy Campbell.
El nombre "Major Tom" está tomado de la canción de David Bowie Space Oddity.
The Boss se modeló tras la actriz Charlotte Rampling.
El pájaro de The End es el abuelo del de Emma Emmerich de MGS2.
Los nombres de la unidad Cobra son emociones nacidas de la guerra. Originalmente, The End era llamado The Doom. Se cambió para evitar problemas con el reciente Doom 3.
Hideo Kojima escuchó la canción Way to Fall de Star Sailor y le encantó. Tomó la decisión de utilizarla como canción en los créditos finales sin decírselo al equipo de producción.
Harry Gregson Williams, el compositor, deseaba crear temas con ambiente de jungla. Kojima, que había pensado en el mismo escenario teniendo en mano potentes tecnologías que no tenía en las entregas de MSX 2, sabía que ya tenía el escenario idóneo.
Algunas ideas rescatadas de Metal Gear Solid 2: la idea del soldado de cien años Oldboy, que se convirtió en The End; el maestro de Big Boss, Oldboy, que dejó paso a The Boss; la idea de un personaje tipo Spiderman de Raiden que finalmente fue para The Fear, o la habilidad de usar armas en el agua.
El minijuego de la pesadilla de Snake es una demo del juego Guy Savage, todavía en producción, y dirigido por Shuyo Murata.
El modelo poligonal de Naked Snake es diferente del de Solid Snake. Como resultado, Naked tiene puntos de emoción facial más detallados, haciéndole más flexible y móvil también.
La serpiente abandonando el cuerpo de The Boss simboliza su libertad, una vez ya ha completado la misión.
La pelea final entre Ocelot y Snake significó un auténtico infierno para la captura de movimientos.
Cuando en el avión Snake recuerda las palabras de The Boss y su consejo de CQC, es un homenaje a Star Wars.
Kojima asegura que Ocelot considera a Big Boss como su maestro. Muchos años después, éste se uniría a su unidad, FOXHOUND, porque quería estar en el mismo bando que él, pero Big Boss ya estaba muerto.
La secuencia final no fue diseñada para hacer llorar. Kojima aseguró que le preocupaba el hecho de que el jugador rompiera a lágrimas.
La frase de Snake ¿Significa esto que FOX va a morir? es una referencia a FOX DIE del Metal Gear Solid original.
Para los combates CQC de Snake y The Boss, se grabó varias veces la rutina de movimientos: una vez con el encargado de las acciones de Snake y otra con Motosada Mori, consejero militar. Se decidió guardar los más dolorosos. Al final, la mayoría de los ataques que quedaron en el juego fueron ejecutados por Mori.
Hirata Eriko, la actriz de la captura de movimientos de The Boss, durante la filmación de su frase ¡Vuelve a casa! (en el primer encuentro con Snake en la operación Snake Eater) rompió a llorar. Había leído el guión, y sabía cómo sería el destino de su personaje.
La idea de The Boss apuntando a Snake fue añadida posteriormente. No estaba en el guión original.
La animación de The Boss colocándose su parca y subiendo al caballo fue un auténtico problema para el equipo: se tardaron varios días en realizar, así como el pelo de Eva en su primera aparición.
Simbolismo: la parca negra de The Boss bajo su traje blanco.
Snake mareándose cuando se levanta después del encuentro con Eva no estaba en el guión original.
Cuando Snake y Granin charlan y aparecen diversos artworks de Yoji Shinkawa, originalmente se mostraban imágenes de oro y tesoros históricos de los Nazis, así como imágenes de la Segunda Guerra Mundial. Más tarde, se mostraría al padre de Volgin, y como éste era asesinado por su hijo. Esto fue eliminado.
Las armas de The Fear se llaman William Tell (que usa en combate a larga distancia) y Little Joe (la que lleva The Boss más tarde).
Un detalle curioso es la foto que muestra a Volgin y a Raikov sonrientes. Y lo más curioso es que la mano del coronel está en la entrepierna de Raikov, pero no llegamos a verlo.
El plano del cadáver de Granin "volando" es un homenaje a La Jungla de Cristal 2 cuando Bruce Willis esquiva las granadas del avión.
El modelado de cadáver de Granin era terrorífico para el equipo creador. Demasiado. Así que cambiaron la iluminación y lo retocaron un poco.
Hay una secuencia cortada en la que Snake ve a The Sorrow siguiendo el caballo de The Boss.
El modelado de la cara en fuego de The Fury se basa en La Momia, cuando los protagonistas son perseguidos por arena con forma del rostro del villano.
El golpe final de Volgin a Snake en la paliza es un homenaje a A Better Tomorrow de John Woo: en cámara lenta y derribando a un personaje.
El sonido de Snake intentando respirar con la bolsa de plástico en su cabeza se consiguió realmente tal como es, con un micrófono dentro de la bolsa.
El salto de la cascada de Snake es un claro homenaje a El Fugitivo.
Originalmente, Volgin destruyendo la radio de Eva no estaba planeado en el guión original.
El traje de The Boss era originalmente azul, como el de Snake en Metal Gear Solid. Pero se cambió a blanco para que pudiera "mezclarse" en el campo de flores.
Cuando Kojima imaginó a The Boss, pensó en una madre con un pecho al descubierto, alimentando a su niño, que incluso podría entrar en batalla. Cuando la diseñó, lo hizo con un tatuaje de una serpiente en el pecho. Cuando disparaba, su pecho se movía dando la ilusión de que la serpiente estaba riéndose.
