Los Metal Gear Solid son como piezas de un puzzle... a pesar de que cada una tenga un orden cronológico no son nada sin el resto.
Para empezar a entender la saga lo mejor sería empezar por las dos entregas de MSX, pero como hoy en dia son algo dificiles de digerir quizas por su apartado gráfico (no me malinterpreteis a mi me encantan) te recomiendo que empieces por Metal Gear Solid de PSX, leyendote el resumen que hay en el mismo de las dos entregas antes mencionadas.
Despues sigue con su continuación en PS2, Sons of Liberty ya que su argumento continua con el ocurrido en PSX. Ahora bien, esta entrega sin duda es la mas dificil de entender, tanto que debes saber que paso antes de todo, el origen de la saga, patriots, etc...(MGS3 Snake Eater) como lo que ocurre despues (MGS4 Guns of the Patriots) para entenderla en su totalidad.
Resumiendo, la entrega mas dificil de entender es la segunda, y la mejor forma de seguir la saga es en el orden cronológico que fueron apareciendo estas en el mercado, asi tiene mas gracia enterarte del argumento y de las sorpresas que esconde.