El vlc es un visor de videos que reproduce practicamente todos los formatos (incluso archivos corruptos o incompletos), usa sus propios codecs y no requiere que te instales los packs de codecs que andan por ahí (algunos de ellos con spyware o adware).
Pero el VLC NO tiene ningún tipo de relación con el hackeo de cuentas de messenger, al menos si te lo descargas de su página oficial, es de código abierto y tiene Licencia Pública GNU, es totalmente confiable.
El posible hackeo de tu cuenta viene de manos de algún desaprensivo que se ha valido de los numerosos métodos existentes para hackear una cuenta de correo de hotmail, sólo que ha coincidido con tu reciente instalación.
No renuncies a un excelente reproductor de video por un motivo que no es tal.
Respecto al hackeo, intenta recuperar el control de la cuenta y cambia la contraseña, la pregunta secreta y todo lo que pueda indicar la manera de volver a quitártela, mucha suerte que esto es una gran putada.