Pero has parado la play o algo raro? Los datos se reescriben solos en este archivo, se guarda automáticamente, y cuando le das a continuar partida, pues en teoría deberías aparecer donde habías guardado. Y cuando te pasas el juego puedes escojer todas las misiones y hacerlas a la dificultad que prefieres, es muy raro lo que te pasa a ti, prueba de reiniciar la máquina y el juego.
Saludos