Snake no sera clonado, es evidente, pues Kojima no quiere que se use mas a ese personaje.
Snake en un principio, iba a morir junto a Otacon, juzgados por criminales, que actúan a espaldas de las máximas organizaciones mundiales, y sin su permiso, ese era el final idóneo, Snake y Otacon juzgados ante la justicia como criminales.
Kojima declaro que ese era el final adecuado para la saga, pero que sus colaboradores no estuvieron de acuerdo y entonces modificaron el final -no me lo invento, esta sacado de la entrevista de la revista EDGE a Kojima-.
Sin embargo el nuevo final creo que sera épico, quizás Snake muera, o quizás no, todo es posible, pero lo que mas me gustaría es que Snake muriera de cansancio, no por el retro-virus FoxDie, ni por ser un clon de genes recesivos, sino por el cansancio de la batalla.