Lo de desfragmentar es cosas del windows, que te pone el disco duro patas arriba...
Pero realmente un disco duro no hace falta desfragmentarlo, de hecho, otros sist. operativos, vease linux (creo) no tiene herramienta de desfragmentar ni nada por el estilo, mas que nada porque no hace falta, ya que las cosas se instalan y se graban en el HD de forma ordenada.